玉溪農業職業技術學院前身是始建于1956年的玉溪農業學校。1993年學校被省政府認定為“省部級重點中專學校”；2000年被教育部評定為首批“國家級重點中專學校”；2002年學校升格為高職院校，成為玉溪市唯一一所以舉辦職業技術教育為主的全日制普通高等學校。目前已形成以專科為主體，中專、本科多層次學歷教育和服務類短期培訓并存的辦學格局, 先后開設了煙草栽培技術、園藝技術、畜牧獸醫、財務會計、計算機應用技術、農畜特產品加工、農業經濟管理、室內設計技術等27個專業，涵蓋種植技術、養殖技術、電子信息技術、財經管理、農產品加工技術、公共事業管理與服務、設計技術七大職業門類，初步形成較為合理的專業結構體系。
學院堅持內涵式發展，以服務“三農”為宗旨，以就業為導向，以教學為中心，走產學結合的發展道路,在人才培養模式探索、教學管理、專業建設等方面取得一些成果。
◆ 2008年，學院被省教育廳評為“云南省高校教學管理先進單位”
◆ 2010年，學院被云南省高職高專學會評為“云南省職業教育先進集體”。
◆ 2008年，園藝藝被省教育廳評為“云南省高校教學管理先進集體”。
◆ 2007年，由中央財政支持投資300萬元建設了園藝技術專業實訓基地，2009年12月已建成。
◆ 2008年煙草栽培技術專業校外實訓基地建設成為了省級示范性實訓教學基地。
◆ 2009年畜牧獸醫專業校外實訓基地建設成為了省級示范性實訓教學基地。
◆2012年煙草栽培技術專業獲中央財政“支持高等職業學校提升專業服務產業發展能力”項目支持。
◆ 就業率持續穩定，近年來先后獲得就業目標責任考核先進獎、優秀獎、二等獎等獎項。并組建寵物醫院、裕生商行等實體，為學生就業、創業提供實踐機會。
◆ “十一五”期間，為當地的煙草行業培養、培訓種煙能手1萬余名，烘烤能手3000余名，烤煙輔導員5000余名，煙葉收購人員1000余名，預檢人員500余名。
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