基礎醫學部下設4個行政科室，15個教研室，5個實驗室和3個實驗中心，是以培養醫學人才為主體的重要教學單位，每年承擔學校近43 %的教學任務。擁有1個博士后科研流動站（基礎醫學），1個博士授予點（病理與病理生理學方向），7個碩士學位授予點，1個基礎醫學本科專業（醫學生物技術方向），4個省級重點學科，8門省級精品課程。
近5年來，基礎醫學院獲國家自然科學基金科研項目15項，973子課題1項，教育部重點科研項目1項，教育部“春暉計劃”科研合作項目2項，教育部高等學校博士學科點專項基金2項，貴州省優秀人才省長基金項目、貴州省優秀青年人才項目、貴州省委組織部特助經費、貴州省科技攻關項目、貴州省科技基金、貴州省國際合作項目、貴州省教育廳基金、貴州省衛生廳基金等項目143項，市、院級科研項目55項，合計資助金額達1400萬余元。國內外公開發表論文近600篇，其中核心期刊327余篇，SCI收錄29篇，主編教材8部，參編教材27部。
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