合肥工業大學生物醫學工程專業創辦于2001年，培養從事生物醫學工程信息及醫學電子儀器領域的高級工程技術人才。要求學生較系統地掌握電子技術、計算機技術、信息處理技術和智能控制等學科的基礎理論與專業知識，并掌握一定的生物學與醫學的基礎知識，具有將生物醫學與工程技術相結合的科學研究能力。
該專業的主干課程包括：電路理論、電子技術、生物化學、解剖學、生理學、電磁場理論、信號與系統、數字信號處理、圖象處理、生物醫學信號檢測與傳感器、生物醫學信號處理、計算機原理及其應用、醫學電子及智能儀器等。
學生畢業后，可在生物醫學電子工程、醫學電子儀器、醫學信息處理以及其他電子技術、計算機技術、信息技術的應用領域從事科研、教學及管理等方面的工作。本專業的畢業生具有基礎扎實、專業面寬和創新意識強的特點，深受用人單位的歡迎，近年來本專業畢業生一次就業率近95%。
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