食品藥品學院始建于1989年，學院前身為農產品加工系。經過二十多年的發展和積淀，現在已發展成為一個學科專業優勢明顯、特色鮮明的學院。學院現有食品科學與工程（國家級卓越工程師教育培養計劃試點專業）、食品質量與安全（省級卓越工程師教育培養計劃試點專業）、中藥學（校特色專業）、烹飪與營養教育、藥物制劑、糧食工程6個本科專業。學院于1998年開始招收本科生，2013年開始招收農業推廣（食品加工與安全方向）碩士研究生。現有在校生1402人（含研究生3人）。
學院現有教職工42人，其中教授、副教授14人，碩士生導師3人，博士（含在讀博士）11人；省教壇新秀1人、校教壇新秀3人、校中青年骨干教師3人；有安徽省家禽產業技術體系崗位專家1人，安徽省中藥材產業技術體系崗位專家1人，安徽省企業科技特派員1人。
學院具有優良的辦學基礎和條件，建有1個國家級大學生校外實踐教育基地、1個安徽省餐飲人才培養示范基地；擁有1個省級重點學科（農產品加工與貯藏工程）、1個省級食品工程實驗實訓中心、1個省級糯米制品工程技術中心、2個安徽省現代農業產業體系功能研究室及1門省級精品課程（食品工藝學）；設有食品科技園、中藥科技園2個科技園以及中藥研究所、食品科學技術研究所2個研究所和1個食品藥品分析檢測中心。
學院以培養“能下去、能留住、能用上、能干好”的“四能”人才為目標，先后與雨潤集團、盼盼食品、蒙牛乳業、杭州藝福茶業、安徽滬譙中藥飲片廠等省內外10余家企業建立了長期穩定的教學實習基地和生產實習基地，在校本科生先后在全國高校餐旅類專業大學生創業大賽、大學生創業大賽、名廚烹飪大賽、動植物標本大賽等省內外競賽中多次榮獲國家級、省級獎項；學院先后培養出了李曉軍（浙江省就業創業優秀個人、品牌中國2012中國茶行業年度經濟人物）、吳勇（共青團郎溪縣委員會委員、常委、書記）等一批優秀的學子。近幾年來，考研錄取率居學校前列，畢業生就業率均在96%以上。
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