資源環境科學菁英班:“資源環境科學菁英班”是南京農業大學與中國科學院南京土壤研究所聯合培養創新人才的新模式。“資源環境科學菁英班”學生的招生、本科階段的培養由南京農業大學負責，按照南京農業大學管理制度進行管理，并在南京農業大學完成課程學習。“菁英班”將發揮南京農業大學教學資源優勢，充分利用中國科學院的學科和科研條件，探索校所聯合、科教結合、協同創新、培養具有扎實理論基礎和鮮明專業特色英才的新模式、新機制，共同培養資源環境及相關學科領域高水平研究型人才。
在本科階段培養期間，中國科學院南京土壤研究所和南京農業大學資環學院選派優秀副高級以上職稱教師或研究人員作為導師，并提供科研訓練與實踐創新機會，旨在加強學生實踐教學環節和專業技能訓練、培養學生創新意識和科研素質、增強學生分析問題和解決問題的能力;雙方將選派優秀科研人員(導師)從二年級或三年級開始為“菁英班”開設學術前沿講座;“菁英班”二年級暑假，中國科學院南京土壤研究所和南京農業大學資環學院提供3周的實驗室輪轉(Rotation)機會;設立“菁英班”獎學金，另，在本科階段學習期間，“菁英班”學生在土壤所參加科研實踐活動時可按土壤所規定享受科研助理崗位待遇;為“菁英班”學生優先提供國際訪學機會。“資源環境科學菁英班”學生的本科畢業條件及學士學位授予資格按南京農業大學的相應規定進行審核，同時可獲得由南京農業大學和中國科學院南京土壤研究所聯合頒發的學習證明。
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