工學院位于南京市浦口區，南臨長江，北依秀麗的老山。現有教職工450多人，全日制在讀本科生5000余人，博士、碩士研究生近400人，成人教育學生500多人。六十年多來，培養了包括專家、學者、企業家、黨政管理等各類人才3萬余人。
現有農業機械化系/交通與車輛工程系、機械工程系、電氣工程系、管理工程系、基礎課部和培訓部等教學單位。設有農業機械化及其自動化、交通運輸、工業設計、機械設計制造及其自動化、農業電氣化、電子信息科學與技術、自動化、工業工程、工程管理、物流工程、車輛工程、材料成型及控制工程等12個本科專業。農業機械化及其自動化專業為國家級特色專業，農業電氣化為省級特色專業。《農業機械學》、《汽車拖拉機學》被評為國家精品課程。
設有農業工程博士后流動站，農業工程一級學科博士學位授權點，農業工程、機械工程、管理科學與工程一級學科碩士學位授權點和檢測技術與自動化裝置二級學科碩士學位授權點以及工程碩士(農業工程、機械工程和物流工程領域)和農業碩士(農業機械化領域)專業學位授予權。
長期以來，學院瞄準國家戰略目標和社會發展需求，依托農業工程優勢學科，在現代農業裝備理論與技術、土壤-機器系統、耕種收農業機械設計、拖拉機電液控制技術、設施農業環境模擬與控制、先進制造技術、農村能源等領域開展重點攻關，研究成果受到國內外矚目。近五年，承擔國家科技支撐、國家863計劃等各類項目100多項，獲國家、省部級科研成果獎6項，發表學術論文1000多篇，被SCI、EI、ISTP收錄300多篇，出版著作、教材近百部。
學院高度重視學生實踐能力和創新能力培養。建立國家級、省級、校級、院級四層次的大學生科研訓練計劃體系，每年立項約160項科研訓練計劃。組織學生參加全國大學生方程式汽車大賽、中國機器人大賽、全國大學生電子設計競賽等30余項課外學術科技競賽。為學生搭建課內自主學習，課外自主科研訓練的廣闊平臺，提高了大學生的科研素質、實踐能力、創新能力以及就業競爭力。
面向未來，按照學校黨代會提出的建設世界一流農業大學奮斗目標，學院秉承學校百年辦學傳統，踐行“誠樸勤仁”校訓，發揚艱苦奮斗、務實奮進的優良傳統，營造團結融洽、和睦和諧的校園文化氛圍，發揮農業工程學科優勢，堅持以工為主、理工結合、農工融合，為建設有特色高水平學院努力奮斗。
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